高低壓配電系統中諧波的存在會帶來多方面的危害：對于變壓器，諧波電流可導致銅損和雜散損耗增加，諧波電壓會增加鐵損。    

 會導致油浸式變壓器在運行中自身功率損耗增加而造成用電浪費；對于功率因數補償電容，諧波會產生振蕩放大，造成電容器過載、損壞，影響補償功能的正常發揮，從而導致運行功率因數降低，無功損耗增加，產生大量的用電浪費，增加電費支出；對電力電纜，諧波電流會產生集膚效應和鄰近效應，增加輸電損耗，導致電纜溫升，從而加速電纜的老化，埋下事故隱患；對電動機，諧波電流可引起鐵損與銅損的增加，引起額外溫升，并可導致機械振動，加劇設備的損耗等；對于照明設備，由于諧波影響而引起的電壓畸變會造成燈具瞬間過電壓或欠電壓，因而導致照度變化，并導致燈具在短時間內損壞而造成浪費；諧波干擾還會導致采用電子式保護的框架斷路器（ACB）由于檢測到諧波電流而產生不易查明原因的保護脫扣。由此可見，諧波的防治對提高設備的利用率，降低運行成本和保證運行平穩有很大的幫助。

 解決諧波問題，是保證配電系統安全、經濟、平穩運行的關鍵。

 諧波影響在配電系統中主要表現在以下幾個方面：
    增加無功損耗，降低功率因數，增加變壓器的損耗，降低其利用效率；
    零序諧波電流匯集到零線，造成零排過載發熱，嚴重時燒斷零線，造成事故；
    諧波干擾導致采用電子保護技術的框架斷路器在工頻電流正常的情況下脫扣，影響系統正常運行；
    負序諧波電流在感應電動機上產生逆力矩，造成電動機的長期機械疲勞而過早損壞；
    諧波集膚效應導致變壓器、電線電纜、電動機線圈發熱老化，影響其使用壽命；
    諧波的高頻輻射效應對電子通訊設備系統產生干擾，影響其信號系統的穩定性，造成瞬間信號紊亂、控制失靈，系統無故停機并瞬間再啟動或無法啟動；

在有低壓補償的系統中，諧波在變壓器感抗與電容器容抗的LC回路中產生并聯諧振，成諧波電流被數十倍地放大，燒毀控制系統設備，主要是控制設備的電源部分。